Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PANK4Q9NVE7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PANK4Q9NVE7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PANK4Q9NVE7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PANK4Q9NVE7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PANK4Q9NVE7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms