Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM30AQ9NV96 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM30AQ9NV96 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM30AQ9NV96 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms