Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD18Q9NS91 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD18Q9NS91 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD18Q9NS91 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms