Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6BQ9NRW1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6BQ9NRW1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6BQ9NRW1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB6BQ9NRW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms