Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN4Q9NQP4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PFDN4Q9NQP4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms