Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MEPEQ9NQ76 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MEPEQ9NQ76 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms