Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD93Q9NPY3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD93Q9NPY3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CD93Q9NPY3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms