Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FANCFQ9NPI8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FANCFQ9NPI8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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