Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A4GALTQ9NPC4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A4GALTQ9NPC4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms