Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB18Q9NP72 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB18Q9NP72 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB18Q9NP72 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 464.5 ms