Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFGAP3Q9NP61 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms