Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PARVBQ9HBI1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVBQ9HBI1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms