Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y2

RPF1, Ribosome production factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF1Q9H9Y2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPF1Q9H9Y2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPF1Q9H9Y2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPF1Q9H9Y2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPF1Q9H9Y2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPF1Q9H9Y2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPF1Q9H9Y2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPF1Q9H9Y2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPF1Q9H9Y2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPF1Q9H9Y2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms