Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ELP3Q9H9T3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ELP3Q9H9T3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms