Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7BQ9H9Q2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms