Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C10orf88Q9H8K7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C10orf88Q9H8K7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C10orf88Q9H8K7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C10orf88Q9H8K7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms