Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR55Q9H6Y2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR55Q9H6Y2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms