Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMPQ9H6B4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLMPQ9H6B4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLMPQ9H6B4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLMPQ9H6B4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms