Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP62CLQ9H1M0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP62CLQ9H1M0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP62CLQ9H1M0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP62CLQ9H1M0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP62CLQ9H1M0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP62CLQ9H1M0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP62CLQ9H1M0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP62CLQ9H1M0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP62CLQ9H1M0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP62CLQ9H1M0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP62CLQ9H1M0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP62CLQ9H1M0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP62CLQ9H1M0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP62CLQ9H1M0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms