Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 515.5■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 59.57□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 39.36□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 ABR-226ENST00000574257 532 ntTSL 411.12□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 ABR-216ENST00000572152 637 ntTSL 39.39□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 522.84■■□□□ 1.255e-9■■■■■ 28.9
CSTF2TQ9H0L4 LMF1-211ENST00000568268 578 ntTSL 417.68■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 28.8
CSTF2TQ9H0L4 MXI1-209ENST00000484030 838 ntTSL 56.59□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 28.8
CSTF2TQ9H0L4 ANO7-204ENST00000451047 555 ntTSL 320.46■□□□□ 0.873e-7■■■■■ 28.8
CSTF2TQ9H0L4 ANO7-208ENST00000481071 1905 ntTSL 516.49■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 28.8
CSTF2TQ9H0L4 ANO7-205ENST00000459928 2139 ntTSL 1 (best)16.44■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 28.8
CSTF2TQ9H0L4 ANO7-209ENST00000487192 2196 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 28.8
CSTF2TQ9H0L4 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 28.8
CSTF2TQ9H0L4 ANO7-201ENST00000274979 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 28.8
CSTF2TQ9H0L4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.275e-9■■■■■ 28.8
CSTF2TQ9H0L4 MAEA-210ENST00000508634 694 ntTSL 215.58■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 28.8
CSTF2TQ9H0L4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.281e-22■■■■■ 28.8
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.866e-11■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 SAP130-205ENST00000450957 559 ntTSL 419.44■□□□□ 0.77e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.666e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.636e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.287e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.047e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-219ENST00000601336 754 ntTSL 217.96■□□□□ 0.477e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.417e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.047e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-214ENST00000599719 1473 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.237e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.247e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.377e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-218ENST00000601309 672 ntTSL 511.28□□□□□ -0.67e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.627e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL1-211ENST00000597725 573 ntTSL 49.39□□□□□ -0.917e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 519.72■□□□□ 0.753e-7■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 38.15□□□□□ -1.17e-7■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 PPP2R3B-201ENST00000381625 782 ntTSL 519.54■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 513.87□□□□□ -0.198e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.218e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.328e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.438e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.478e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.58e-8■■■■■ 28.7
CSTF2TQ9H0L4 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.363e-15■■■■■ 28.6
CSTF2TQ9H0L4 YWHAZ-213ENST00000492736 681 ntTSL 320.41■□□□□ 0.863e-9■■■■■ 28.6
CSTF2TQ9H0L4 CLOCK-210ENST00000513033 567 ntTSL 416.91■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 28.6
CSTF2TQ9H0L4 CLOCK-208ENST00000509151 476 ntTSL 414.91□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 28.6
CSTF2TQ9H0L4 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 28.6
CSTF2TQ9H0L4 CLOCK-206ENST00000506923 616 ntTSL 34.31□□□□□ -1.724e-7■■■■■ 28.6
CSTF2TQ9H0L4 TECPR1-208ENST00000471397 774 ntTSL 318.72■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 TECPR1-207ENST00000463648 491 ntTSL 316.38■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-221ENST00000556600 751 ntTSL 319.72■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-219ENST00000555987 557 ntTSL 419.72■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-213ENST00000554818 552 ntTSL 313.83□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-215ENST00000555307 1039 ntTSL 512.92□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-209ENST00000554315 1740 ntTSL 1 (best)12.87□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-225ENST00000557031 567 ntTSL 412.29□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-230ENST00000557774 847 ntTSL 212.19□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-222ENST00000556700 529 ntTSL 410.77□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-206ENST00000553415 694 ntTSL 49.74□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-202ENST00000356296 3453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-210ENST00000554394 954 ntTSL 37.72□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMB-220ENST00000556112 568 ntTSL 45.12□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 417.1■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 414.38□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.769e-7■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 SBNO2-209ENST00000590998 562 ntTSL 413.5□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 PLCXD1-208ENST00000445062 555 ntTSL 420.52■□□□□ 0.885e-9■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 PLCXD1-205ENST00000429181 469 ntTSL 413.96□□□□□ -0.175e-9■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.55e-9■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 315□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 28.5
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-221ENST00000567999 578 ntTSL 1 (best)20.27■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-224ENST00000569061 651 ntTSL 517■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-204ENST00000561784 612 ntTSL 416.64■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-217ENST00000566820 549 ntTSL 415.31■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-203ENST00000561741 580 ntTSL 414.9□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-209ENST00000562986 468 ntTSL 414.79□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-216ENST00000566079 516 ntTSL 514.62□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-222ENST00000568096 543 ntTSL 514.61□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-208ENST00000562578 573 ntTSL 414.44□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 28.4
CSTF2TQ9H0L4 DEF8-226ENST00000569803 539 ntTSL 513.49□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 28.4
Retrieved 100 of 19,151 protein–RNA pairs in 461.4 ms