Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SENP6Q9GZR1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP6Q9GZR1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SENP6Q9GZR1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP6Q9GZR1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms