Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP39Q9C0H5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP39Q9C0H5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP39Q9C0H5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP39Q9C0H5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP39Q9C0H5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGAP39Q9C0H5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP39Q9C0H5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP39Q9C0H5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms