Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP44Q9C0F1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms