Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NLRP1Q9C000 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NLRP1Q9C000 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NLRP1Q9C000 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms