Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPEB1Q9BZB8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPEB1Q9BZB8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPEB1Q9BZB8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms