Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL1Q9BYD6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL1Q9BYD6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL1Q9BYD6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms