Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPL3Q9BY60 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPL3Q9BY60 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms