Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM2Q9BVW6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms