Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C2orf88Q9BSF0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf88Q9BSF0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms