Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EBF4Q9BQW3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBF4Q9BQW3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBF4Q9BQW3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 377.7 ms