Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARID3AQ99856 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3AQ99856 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3AQ99856 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms