Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHP1Q99653 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHP1Q99653 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHP1Q99653 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms