Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP4Q99569 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKP4Q99569 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKP4Q99569 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms