Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UHRF1Q96T88 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UHRF1Q96T88 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UHRF1Q96T88 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms