Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PNKPQ96T60 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PNKPQ96T60 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNKPQ96T60 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms