Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SIN3AQ96ST3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SIN3AQ96ST3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SIN3AQ96ST3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms