Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP8

KCNA7, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 7, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA7Q96RP8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA7Q96RP8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA7Q96RP8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA7Q96RP8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms