Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR1H4Q96RI1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR1H4Q96RI1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1H4Q96RI1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms