Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA5Q96PV4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PNMA5Q96PV4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PNMA5Q96PV4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PNMA5Q96PV4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PNMA5Q96PV4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PNMA5Q96PV4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNMA5Q96PV4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA5Q96PV4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA5Q96PV4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms