Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD4LQ96PU5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD4LQ96PU5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD4LQ96PU5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms