Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE2

ARHGEF17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF17Q96PE2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF17Q96PE2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF17Q96PE2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF17Q96PE2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF17Q96PE2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARHGEF17Q96PE2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF17Q96PE2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF17Q96PE2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF17Q96PE2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF17Q96PE2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF17Q96PE2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF17Q96PE2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF17Q96PE2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF17Q96PE2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF17Q96PE2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF17Q96PE2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms