Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPR78Q96P69 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPR78Q96P69 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms