Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP3Q96P47 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGAP3Q96P47 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP3Q96P47 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms