Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP57Q96MR6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP57Q96MR6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP57Q96MR6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms