Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCMTD1Q96MG8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCMTD1Q96MG8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms