Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC138Q96M89 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC138Q96M89 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC138Q96M89 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 488.6 ms