Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKNOX2Q96KN3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKNOX2Q96KN3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKNOX2Q96KN3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms