Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPTM1LQ96KA5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLPTM1LQ96KA5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1LQ96KA5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.4 ms