Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
LRRIQ1Q96JM4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRRIQ1Q96JM4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
LRRIQ1Q96JM4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LRRIQ1Q96JM4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
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