Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ABCC12Q96J65 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCC12Q96J65 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ABCC12Q96J65 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms